Vykdydamas savo misiją supažindinti visuomenę su pasaulio ir Lietuvos gyvūnijos įvairove, raida, gamtiniais saitais, būkle ir su zoologijos mokslu, muziejus įsigyja, tyrinėja, aprašo, kaupia ir eksponuoja gyvūnijos, kaip žmonijos gamtinės aplinkos, materialiuosius ir nematerialiuosius liudijimus. Muziejus yra mokymosi ir mokslinių tyrimų vieta, zoologinės informacijos kaupėjas ir teikėjas.
